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<p><img alt="8959a9a0e6adc61b6db57a2c7eb47af8.png" src="https://beijingoptbbs.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/cs/5606289-e8ea9e09a9036a49edad3a01cef94af9.png"></p>
<h1>背景介绍(Introduction)</h1>
<h2>宏基因组学</h2>
<p>宏基因组学目前的主要研究方法包括：16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组和代谢组，其中以扩增子研究最为广泛。</p>
<h2>目的意义</h2>
<p>本系列文章将带领大家结合较新的16S/ITS扩增子相关文献，来理解宏基因组扩增子文章中常用图表种类、图中包括的基本信息，以及作者想表达的结果。</p>
<h2>主要内容</h2>
<p>本系列文章内容包括：箱线图、折线图、柱状图、散点图、火山图、热图、曼哈顿图、维恩图、三元图和网络图等。</p>
<h2>学习思路</h2>
<ol><li><p>罗列知识点，熟悉专业名词，弄个脸熟，即使理解不深刻起码在阅读中不会有抵触情绪；</p></li><li><p>结合具体文章读图，实战两三次，基本就是专业人士了。</p></li></ol>
<p>将来在大家可以很好理解相关文章图表的基础上，希望对分析、统计和绘图相关技术有进一步学习的小伙伴请积极回复并留言吧。如果本系统文章阅读过万，想学分析的留言过百。我还将详细讲解扩增子分析、统计和绘图各步骤的分析实例和源代码，希望大家多多鼓励和支持。</p>
<p>声明：文章的解读仅代表个人理解和观点，有不足处，请读者积极留言批评指正，互相学习，共同进步。</p>
<h1>知识点(Method)</h1>
<h2>三元图/三元相图 Ternary Plot</h2>
<p><img alt="c7feff3976f3ef3c4d93ce4d3cdef916.png" src="https://beijingoptbbs.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/cs/5606289-3c5ab62acadaa2ed08c087a2ab97976c.png"></p>
<p>三元图有6种英文叫法，其中ternary plot最为常用。三元图是重心图的一种，它有三个变量，但需要三者总和为恒定值。在一个等边三角形坐标系中，图中某一点的位置代表三个变量间的比例关系。常用于物理化学、 岩石学、矿物学、冶金学和其它物理科学，用于表示在同一个系统中三组分间的比例。在群体遗传学中，它被称做Finetti图；在博弈论中，常被称为simplex图。<br>A ternary plot, ternary graph, triangle plot, simplex plot, Gibbs triangle or de Finetti diagram is a barycentric plot on three variables which sum to a constant. It graphically depicts the ratios of the three variables as positions in an equilateral triangle. It is used in physical chemistry, petrology, mineralogy, metallurgy, and other physical sciences to show the compositions of systems composed of three species. In population genetics, it is often called a de Finetti diagram. In game theory, it is often called a simplex plot.<br>在高通量测序分析领域中，最常用的是两组间的比较，展示的方式有火山图、曼哈顿图等，而三组互相两两比较需要展示三个图吗？就没有更好的展示方式了吗？三元图的引入解决了这一问题。近年来，常用于展示三组间的相对基因表达或OTU丰度，即美观，又有意义。</p>
<h2>三元图的传统应用</h2>
<p>上图示例是化学领域中传统应用，展示在空气中(氧21%，氮79%)中混入甲烷(可燃气体)时可燃的范围。图中蓝色线上的任意点，代表其中氧和氮始终保持21：79的比例关系，正是空气的基本性质，即使有甲烷混入氧氮的比例始终恒定；深黄色区域为甲烷在此区域范围内的含量条件下才可燃；而蓝线与深黄区域重合部分，表示只有在空气中混入这一浓度范围内的甲烷才是可燃的。<br>这部分是科普下背景，看不懂没关系，本文下面重点细讲在生物学扩增子分析中的应用。</p>
<h2>三元图点位置的读法</h2>
<p><img alt="92db15d8678db5a662567a4481f28cce.png" src="https://beijingoptbbs.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/cs/5606289-3b3c78992b1283e8a2c93874ccc9036d.png"></p>
<h3>快速看谁多谁少</h3>
<p><strong>快速理解位置意义：重心图，你看目标点离那个角近，就是它在相应的组中相对比例高；反之离某个角远，其相对比例也低。</strong></p>
<h3>精确读三组比例</h3>
<p><strong>1. 双平行线/小等边三角形法：由点向底边做两条平行线建立小正三角形，将底边分成三段，中间为顶部组所占比例，左段为右侧组比例，右段为左侧组比例。</strong></p>
<ol><li><p>垂线法：点向三条边做垂线，穿越的格数，即对角组中所占比例；</p></li><li><p>向各边零坐标方向作平行线 |
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